帕克是在他室友的女友的电脑上看到Facebook的。 此前，帕克已经预见到，启动社交网站的*佳途径是通过一个相对封闭的社区，大学似乎是**的平台。他在网站上溜达了一圈，就给网站创办人、当时还在哈佛大学念二年级的马克·扎克伯格发了一封电子邮件，要求和他见面。
马克·科勒继帕克之后加入Facebook，回忆起那封至关重要的电子邮件，他满怀敬畏：“Napster和Facebook是互联网历史上*重要的两家公司之一。除了创始人，帕克比其他任何人都更早发现它们的潜力。”
帕克飞抵纽约和扎克伯格见面，两人一拍即合。几个月后，2004年6月，扎克伯格邀请帕克搬进Facebook租借的度假屋。就这样，年仅24岁的帕克成为Facebook的*任总裁。那时，帕克正借住在新任女友家。
当时，帕克显然比扎克伯格更相信公司的潜力。Facebook的**位投资者、Paypal 创始人之一彼得·泰尔说：“那时候，肖恩不停地唠叨，说Facbebook将大获成功。如果说马克曾经有过任何怀疑，那么肖恩就是打消疑虑的人。”2004年8月，扎克伯格和帕克到硅谷银行开了一个商业账户。那时距离秋季开学只有两周时间，扎克伯格依然在谈论要返回哈佛继续念书。据银行副经理肯·拉弗勒斯回忆说，两人因为这个问题争论起来。帕克反对扎克伯格返回哈佛，态度强硬。*终，扎克伯格退了学。彼得·泰尔说：“肖恩对Facebook的成功做出的贡献可能没有他想的那么多，但**比其他人认为的要多。”
除了作为扎克伯格的战友，帕克还努力巩固自己的合作者地位，**不会像在Plaxo时一样，再次被扫地出门。帕克还在**方面帮了扎克伯格的大忙，和彼得·泰尔及另一家风投谈判的过程中，帕克为扎克伯格争取到了多数网络新公司闻所未闻的优厚条件—对企业的**控制权。可以说，扎克伯格至今掌握着Facebook的绝大部分股权，很大部分是帕克的功劳。如果不是这样，Facebook恐怕早就被卖给了雅虎或微软。
可没过多久，他又失业了。2005年，在去北卡罗莱纳度假时，他被怀疑藏有毒品而在出租屋被捕。虽然帕克并未被正式起诉，但一些Facebook的投资者觉得，他已经不能再胜任公司总裁。他只有忍痛辞职。
虽然离开的方式依然不光彩，但这一次，帕克再也不是被动挨打。一个重要的原因在于，扎克伯格从未抛弃他。Facebook的董事会成员泰尔说：“我认为肖恩并没有真正离开Facebook，他依然从很多方面参与其中。” 他依旧持有Facebook的大量股份，他和扎克伯格保持着**私交，经常就网站发展提供自己的建议。从某种意义上来说，帕克是扎克伯格幕后的顾问。
